结核病预防控制中心是直属于中国疾病预防控制中心的专门负责全国结核病预防控制业务工作的组织协调和指导中心，也是集结核病预防控制资源协调、业务指导、疫情监测管理、项目组织实施及技术人员培训等功能于一体的国家级专业机构，下设办公室、政策规划部、统计监测部、耐药防治部、患者关怀部、健康促进与培训部、国际合作与研究部、参比实验室、全球基金结核病项目办和中盖结核病项目办。
结核病预防控制中心主要为政府制定有关结核病预防控制的法规、标准、规范及规划等提供技术支持，对全国结核病防治工作进行技术指导、督导检查和考核评价，对全国结核病防治机构实验室工作进行技术指导和质量控制，承担结核病的监测、信息收集、处理、上报和专项分析，实施健康教育策略的制定、评价与推广应用，负责国际合作、援助等项目的实施与管理，组织开展结核病防治的相关研究，开展对外交流与合作，引进和推广先进新技术、新方法，培训专业技术人员，组织编写各类人员培训教材等。